临床中可分初期、中期后期三阶段分型论治。

1. 初期：①以腰酸困，间断血尿，头晕，乏力，腹内结块不大，多在体检行CT、B超检查时发现多囊肾，舌质暗红，舌苔薄白，脉象沉细。此属禀赋不足，肝肾两虚，气血瘀阻，伤于肾络。治宜调补肝肾，行气化瘀。药用:当归、生山药、构杞子、何首鸟、炒杜仲、补骨脂、陈皮、丹参、郁金、鳖甲、三棱、莪术。如伴尿热、尿频，有血尿者，加淡竹叶、瞿麦、黄柏、墨旱莲、小蓟;腹部有包快而有隐痛不适者，加牡蛎、夏枯草、延胡索。②腹胀或痛，重按腹部胀痛较甚，口干纳呆，身沉重，便秘，舌质暗红，舌苔白腻或黄腻， 脉弦滑。此多为饮食不节，七情所伤，内生湿热，气滞血瘀。治宜清热利湿，导滞活瘀。药用:金银花、白花蛇舌草、薏苡仁、滑石、沉香、广木香、台乌药、大黄、枳实、槟榔、丹参、鳖甲、红花。

2.中期：形体较瘦，头晕头痛，胸胁胀满，肿块渐大，按之痛甚，腰酸腰痛，舌质暗红，舌下络脉瘀紫，舌少苔，脉沉弦细。此为病情发展，肾虚肝旺，虚实夹杂，血瘀、痰浊偏盛。此期患者可出现高血压、蛋白尿、血尿、肾功能下降。治宜滋阴潜阳，化瘀散结，祛痰降浊。药用:生地黄、牡丹皮、生牡蛎、生龙骨、桃仁、红花、当归、赤芍、陈皮、茯苓、鳖甲、白花蛇舌草、制大黄。如血压明显升高加夏枯草、决明子:蛋白尿者加山菜英、枸杞子、覆盆子，血尿者加女贞子、墨早莲、茜草，血肌酐、尿素氨升高者加积雪草、刘寄奴、制大黄。

3.后期：腹部胀满，肿块较大，疼痛不适，腰酸腰痛，精神萎靡，面浮晦滞，纳呆不欲食，恶心呕吐，尿量减少，大便不畅，肾功能日渐恶化。舌质淡紫，舌下络脉瘀粗，舌苔厚腻，脉弦细或沉弱。此期病情已到晚期，正衰邪实为主，脾肾亏损，阴虚肝旺，痰瘀结聚，浊毒壅盛。余认为应先健脾和胃顾护胃气，因脾胃为后天之本，在扶正基础上祛痰瘀，排浊毒。药用:生山药、茯苓、陈皮、半夏、竹茹、豆蔻、鸡内金、生牡蛎、三棱、莪术、鳖甲、红花、积雪草、刘寄奴、生槐花、厚朴、制大黄。配服救肾胶囊(院内制剂)，每次2~ 5粒，每日2次。建议患者做血液透析、肾移植。